源于巴林部,“巴林”是蒙古语,汉译为“军寨”。
巴林部是一个古老的部落,最初的部落为巴阿邻氏。它的历史可以上溯到成吉思汗上10世祖,即孛儿只斤氏的始祖孛端察儿。据说孛端察儿从扎儿赤兀惕人中抢来一个妻子,名叫兀良合真氏,婚后又与他生了一个儿子,因为这个儿子是抢来的女人生的,所以取名巴阿里歹。“巴阿里”汉译为“掳取”之意。巴阿里歹就是巴阿邻氏的祖先。他的后代分为四支,即巴阿邻氏、蔑年巴阿邻氏、你出古巴阿邻氏和速客纳惕氏。以后人丁繁盛,形成四部。其中速客纳惕为巴阿里歹的一个儿子与家中女奴野合所生之子。女奴畏惧主人的妻子,便找一僻静之处分娩后将婴儿抛弃到一片怪柳丛中,恰好被主人遇见抱回,交给其妻抚养成人。因“怪柳”蒙语即“速客”,故取名速客纳惕,实与巴阿邻氏异姓而同宗。
到成吉思汗时代,上述四部曾加入过不同的部落联盟,各事其主。后来经巴阿邻部首领豁儿赤兀孙以“长生天命铁木真为鞑靼之主”的梦兆神示,各部才弃其原主改事铁木真。后来,各部在铁木真统一蒙古、建立蒙古帝国的事业中建立了功勋,各部首领均成为开国功臣,被封为千户。其中豁儿赤兀孙在九十五位开国功臣中排名第四,被授予万户兼族长,统领巴阿邻四部。这时巴阿邻各部(又称八邻或霸林)封地在阿尔泰山西北的今俄罗斯境内。至元朝灭亡、元室北徙后,巴阿邻部解体。
北元以后,原来的蒙古各部纷纷解体,新部落重新组合。这时由原巴阿邻籍的蒙古兵为主体,又重新组成部落,并逐步东迁至今辽宁省彰武县一带。达延汗时期,该部属内喀尔喀五部之一,后来由达延汗之孙喀尔喀万户虎喇哈赤将该部分给其次子苏巴海统领。苏巴海为成吉思汗十八代孙,达延汗之曾孙。由于该部是由巴阿邻籍蒙古兵组成,又长期驻扎在军寨,故命名本部为“巴林”,亦与原部落名称谐音。
苏巴海的巴林部拥兵一万五千,在内喀尔喀五部中实力最强。清天聪二年(1628年),其孙色特尔与和托果尔昂哈率部降清。天聪八年(1634年),清政府在西拉沐沦河流域为巴林部划分牧地,巴林部始从辽宁省彰武县迁入赤峰市境内。清顺治五年(1648年),清政府将原巴林部分为左右二旗,封和托果尔昂哈之子满珠习礼固山贝子为巴林左翼旗札萨克;封色特尔之子色布腾辅国公为巴林右翼旗札萨克。
巴林左翼旗札萨克清朝共传十三代,始终为固山贝子,从未升迁。而巴林右翼旗札萨克色布腾,虽开始被封为辅国公,但不久顺治皇帝将其妹固伦淑慧公主下嫁色布腾,色布腾因“额驸”而晋升为多罗郡王,诏“世袭罔替”。以后到清末共传十三代,均袭王爵,其中四代加封亲王,三代任盟长。